Arbeitspaket #2
Entwicklung von wichtigen Standardverfahren
Wissenschaftlich-technische Erarbeitung der wichtigsten Standard-Verfahren auf der Grundlage der Informationen aus AP #1, Implementierung des Konzepts zur Anwendung in einem Routine-Labor, sowie eines Interlaboratory-Tests (im Sinne der Übertragbarkeit der Verfahren in ein weiteres Labor) schon im ISO-Format (Einzelheiten dieses Schrittes, die genaue Grenze, welcher Partner, welchen Teil übernimmt kann noch nicht festgelegt werden, sondern hängt vom jeweiligen Thema bzw. den Erfahrungen ab). Wir evaluieren in
einem faktoriellen Laborexperiment mehrere Variationsquellen des Metabarcoding und der Metagenomik (z. B. DNA-Extraktionstechniken, Wahl der Primer, Sequenzieransatz, bioinformatische Datenverarbeitung). Grundsätzlich wird jeder Entwurf von allen Partnern
kommentiert und diskutiert werden. Die Ergebnisse dieser Evaluierung zusammen mit der wissenschaftlichen Synthese aus AP #1 erlauben die Formulierung von Handlungsoptionen bei der Ansatzauswahl für Endanwender.